奥塔哥大学是新西兰两个最大的研究机构之一(2006年科学技术研究部报告)，也是新西兰研究类排名列居首位的大学(2006年度研究成果基金会的质量评定)。在新西兰大学的专业排名中，奥塔哥大学拥有最多排名第一的专业：生物医学、临床医学、地球科学、经济学、教育学、英语语言和文化、历史和经典、法学、哲学、公共卫生、宗教研究和神学、体育和运动科学。其中，医学专业闻名全世界。

　　奥塔哥大学的大部分研究主题集中于健康科学，包括：哮喘和呼吸障碍、心血管内分泌学、功能基因组学，基因表达和蛋白质组学、免疫学的基础疾病和免疫保护、神经系统的结构和功能、口腔微生物学及牙齿健康、健康和疾病的氧化应激、公众健康、制定和给药、病毒学。其中许多研究项目处于世界领先水平。

　　奥塔哥大学凭借良好的学术声誉和显著的科研优势吸引了海内外众多才华横溢的学子齐聚于此。奥塔哥大学还与亚洲、欧洲和美洲的多所知名学府之间保持着广泛深入的学术往来和生源交流。